心筋梗塞・脳梗塞の遺伝因子の解明と個別化予防への応用

1.　脳梗塞のゲノム全領域関連解析
対象集団A（脳血栓131例・対照135例、病院受診者）について、ゲノム全領域の約52万個のSNPsを同時に解析できるSNPチップを用いてゲノム全領域関連解析を行い、脳血栓発症と強く関連する（P < 1.0 × 10-20）SNPsを100個抽出した。次にこの100 SNPsについて対象集団B中の脳血栓705例・対照3426例（病院受診者）において関連解析を行い、脳血栓に関連するSNPsを3個検出した。これらのSNPsについて脳血栓96例でそれぞれの連鎖不平衡ブロックのシークエンスを行い、エクソンに位置するnonsynonymous（アミノ酸の置換を伴う）SNPsを3個（このうち2個はタグSNPs）およびsynonymous SNP（タグSNP）を1個検出した。これらの4個のSNPsについて、対象集団B（脳血栓790例・対照3435例、病院受診者）において関連解析を行い、3個のSNPsが疾患発症に関連することを認めた。これらのSNPsについてさらに対象集団C（脳血栓71例・対照1779例、地域住民）において関連解析を行い、脳血栓発症と強く関連するcadherin, EGF LAG seven-pass G-type receptor 1（CELSR1）遺伝子の2個のSNPs、A→G（Thr2268Ala, rs6007897）およびA→G（Ile2107Val, rs4044210）を同定した。
2.　心筋梗塞のゲノム全領域関連解析
3つの独立した集団で合計6853例（心筋梗塞2208例および対照4645例）についてゲノム全領域関連解析を行った。まず心筋梗塞134例・対照137例についてゲノム全領域に分布する約52万個の一塩基多型（SNP）を解析するSNPチップを用いてゲノム全領域関連解析を行い、心筋梗塞発症と関連する（P < 1.0×10-7）SNPsを70個抽出した。次に心筋梗塞1431例・対照3161例において解析し、さらに心筋梗塞643例・対照1347例において関連解析を行った。その結果、心筋梗塞発症と強く関連するBTN2A1遺伝子C→T多型（rs6929846）とILF3遺伝子A→G多型（rs2569512）を同定した。